По сюжету ArmA 3 войска НАТО проиграли неким загадочным «восточным армиям» ряд важных сражений и оказались на гране разгрома. В результате командование решается на рискованный шаг — нанести удар по небольшому, но очень важному в стратегическом плане острову в Средиземном море, воссозданному с использованием реальных географических данных. Однако операция провалилась, а отряд диверсантов был практически полностью уничтожен. Уцелел лишь один боец, капитан Скотт Миллер, который и будет главным героем ArmA 3. Миллеру придется пройти путь от бойца-одиночки до командира большого отряда. Выполняя разнообразные задания командования, он будет использовать богатый арсенал и обширный парк боевой техники.

Реалистичность сражений обеспечит физический движок PhysX, а одиночную кампанию дополнят мультииплеером и редактором для создания новых карт и сценариев.