Главными противниками Шепарда и его команды станут армии «Цербера», включающие огромных шагающих роботов и спецназовцев, действующих как ниндзя. Ожидается, что битвы развернутся не только на поверхности планет и в коридорах станций, но и в космосе, где герою будут противостоять огромные корабли Жнецов - в длину они достигают от 500 метров до двух километров. При этом сражения станут еще динамичнее — скорости игры в среднем возрастет на 10-15%.

Сам Шепард освоить несколько новых трюков. Например, он сможет прыгать в сторону и разучит новые приемы ближнего боя — под него даже затачивают один из новых классов. Изменятся и уже знакомые профессии. Например, инженер сможет строить оборонительные турели.